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Il Museo di Storia Naturale di Magonza, situato in Renania-Palatinato, è il più grande del suo genere nella regione. Il museo si concentra sulla biologia e sulle scienze della Terra, non solo in Renania-Palatinato ma anche in Ruanda, paese partner del museo e dello Stato dal 1982. Questa collaborazione offre una prospettiva unica e arricchisce la collezione e le mostre del museo.

L'Orto Botanico dell'Università Johannes Gutenberg di Magonza ospita circa 8500 specie di piante provenienti da quasi tutte le regioni del mondo. Queste piante si trovano sia all'aperto che nelle serre. Questa grande varietà di specie vegetali rende il giardino un luogo affascinante per gli appassionati di piante e per chi è interessato alla biodiversità.

Il Wildpark Mainz-Gonsenheim è un parco faunistico situato nel quartiere Gonsenheim di Magonza, nelle immediate vicinanze della riserva naturale Lennebergwald. Questo luogo offre ai visitatori un'opportunità unica di sperimentare la fauna selvatica in un ambiente naturale, pur essendo convenientemente situato all'interno della città.